Malte offre un environnement d'apprentissage neutre où même les sujets politiquement sensibles peuvent être discutés de manière constructive. Son emplacement en Méditerranée rend son accès facile aux participants d'Afrique, du Moyen-Orient et d'autres régions. L'IIJ est actuellement situé sur le campus de La Valette de l'Université de Malte, l'université nationale maltaise. La construction du Campus de La Valette, communément appelé "Old University Building", a été commencée en 1595 par le Grand Maître Martino Garzes, sa façade extérieure a ensuite été redessinée dans un style baroque en 1647. L'IIJ organise la plupart de ses programmes dans l'ancien bâtiment universitaire, dans des salles de conférence pouvant accueillir jusqu'à 60 participants, ainsi que dans des salles de réunions plus petites pour des programmes en plus petit comité ou pour des activités de groupe.